تهدف رسالة قسم الكيمياء العضوية الصيدلية إلى تدريس أساسيات الكيمياء العضوية لدراسة التراكيب البنائية والتفاعلات النموذجية للطوائف الهامة من المركبات العضوية. أعطاء نظرة عامة على التقنيات الكيميائية والطيفية المختلفة وذلك للتعرف على هوية المركبات العضوية وإثبات التراكيب البنائية لها